認識微生物
微生物主要分为以下几类：
· 原核微生物：细菌（Bacteria）/ 古菌（Archaea）
· 真核微生物：真菌（Fungi）/ 原生动物（protozoan）/ 藻类（algae）
· 非细胞生物：病毒（virus）/ 类病毒（virusoid）/ 拟病毒（viroid）/ 朊毒体（亦称朊毒体、蛋白质质感染性颗粒，prion）
细菌（Bacteria）
大肠杆菌
Escherichia coli
大肠杆菌是一种两端钝圆、能运动、无芽孢的革兰氏阴性短杆菌。大部分的大肠杆菌不会致病，但有些血清型会造成严重的食物中毒或食物污染。无害的菌株是人体肠道中正常菌丛的一部份，会制造维他命K、防止肠道中其他致病菌的生长，对人体有益。大肠杆菌经常透过粪便排放而散布到环境中
每个人每天平均从粪便中排出1011到1013个大肠杆菌。各种粪便细菌和类似的生活在土壤或植物降解物中的细菌（最常见的是产气肠杆菌，学名Enterobacter aerogenes）一起被归为「大肠杆菌群」（coliform）。
大肠杆菌是肠道及阴道的正常寄生菌，它寄生在阴道、会阴、尿道口周围，免疫力衰弱时可引起严重感染、女性的尿道靠近肛门，大肠杆菌容易感染尿道，如厕后，由前往后擦拭干净，避免将肛门的大肠杆菌带到私密处。浸泡于已被大肠杆菌污染之按摩浴池、温泉池、游泳池，也是一种被传染途径。
绿脓杆菌
Pseudomonas aeruginosa
是一种革兰氏阴性菌、好氧、呈长棒形的细菌，只有单向的运动性。牠是一种机会性感染细菌，且对植物亦是机会性感染的。
绿脓杆菌是一种令免疫受损的机会性感染病原，一般影响肺部及泌尿道，或造成烧伤、伤口及其他血液感染，如败血病。虽然很不常有，但绿脓杆菌亦会造成肺炎。在隐形眼镜清洁不完全的状况下也有机会造成眼睛角膜感染。在很多与呼吸器有关的肺炎研究中指出，绿脓杆菌是其中一种需要隔绝的细菌。绿脓菌素(pyocyanin)－一种蓝绿色的有毒代谢物，就是绿脓杆菌的致病因子之一，且在氧化应激下能使秀丽隐杆线虫死亡，但是有研究指水杨酸能抑制绿脓菌素的生成。10%在医院感染的病症都是由绿脓杆菌所引致的。在缺乏适当处理食水质素下，牠亦是引致皮肤炎的其中一种细菌。牠也是造成烧伤感染最普遍的细菌。
露于被污染之按摩浴池、温泉池、游泳池、滑水道、物理治疗池、浴缸（尤其是 木制者）。轻微外伤也有助绿脓杆菌入侵皮肤。绿脓杆菌会使皮肤伤口化脓、眼睛感染等症状。甚至呼吸道、泌尿道生殖系统也可能受感染，严重者可能导致脑膜炎。
白色念珠菌
Candida albicans
是一种能造成伺机性感染的酵母菌，常见于人类消化道与泌尿生殖道的菌群，约有四成至六成健康成人的口腔与消化道中都有白色念珠菌，平时与人体行片利共生，但可在人体免疫缺陷时过度生长而造成念珠菌，是念珠菌属最常见的致病菌种，与热带念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌和克鲁斯念珠菌合计造成了95%的念珠菌症感染，其中白色念珠菌便占了66%，但此比例正持续下降中。白色念珠菌造成的感染有口腔、食道与阴道等处的局部黏膜感染，也有严重的全身性感染，有研究指出后者的致死率高达40%，另有一项统计显示白色念珠菌造成的院内感染在美国每年造成2,800至11,200人死亡。白色念珠菌也是最常在医疗器材上形成生物薄膜的真菌，生物薄膜中的白色念珠菌抗性比游离成长者还高，可随着医疗器材入侵血液中而造成严重感染。
特征为外阴或阴道表皮上附着一堆厚实、奶酪状、白色分泌物，常伴有搔痒、刺痛、灼热感等症状。好发于免疫力较差者，如怀孕、糖尿病患或正在使用抗生素者。
金黄色葡萄球菌
Staphylococcus aureus
为一种革兰氏染色阳性球型细菌。金黄色葡萄球菌在显微镜下排列成葡萄串状，金黄色葡萄球菌无芽孢、鞭毛，大多数无荚膜。是常见的引起食物中毒的致病菌。常见于皮肤表面及上呼吸道黏膜。金黄色葡萄球菌可以适应含高浓度氯化钠的培养基，因此可以用这种选择培养基将该菌分离出来。
金黄色葡萄球菌为表皮之正常菌丛，常造成伺机性感染。细菌引起不同程度的化脓性炎症扩散疾病，如疖、痈、中耳炎、鼻窦炎、骨髓炎和脓毒病等。金黄色葡萄球菌已经进化出了抵抗免疫系统攻击的特征。
金黄色葡萄球菌的金黄色来源于细菌所制造的类胡萝卜素葡萄球菌黄素，这色素可以抵抗身体免疫系统为了杀死病菌而制造的被白血球释放的活性氧。这样金黄色葡萄球菌就可以免于被活性氧杀死。
金黄色葡萄球菌，是一般最常见的感染，会出现发炎、红肿、私密痘等现象，分泌物呈现灰白黏感有鱼腥味。
多重抗药金黄色葡萄球菌
Multiple-resistant Staphylococcus aureus
多重抗药金黄色葡萄球菌（Multiple-resistant Staphylococcus aureus）是金黄色葡萄球菌的一独特菌株，对几乎所有青霉素类抗生素具有抗药性，包括甲氧西林（Methicillin）及其他抗β内酰胺酶的青霉素。MRSA首次发现于1961年的英国，现时已广泛散播，被称为「超级细菌」。
抗药性金黄色葡萄球菌感染主要透过直接传播，身体接触、皮肤有伤口、挤迫环境及个人卫生欠佳，亦有可能造成感染。而病患者的双手若接触过伤口及分泌物，有可能将病菌带到身体其他部分。而健康人士亦可能成为带菌者。
对抗生素已产生抗药性，红肿、触痛、流脓、严重者可引致败血病、肺炎、坏死性筋膜炎。
对抗生素已產生抗药性，红肿、触痛、流脓、严重者可引致败血病、肺炎、坏死性筋膜炎。
阴道加德纳菌
Gardnerella vaginalis
细菌性阴道病泛指由多种致病菌在阴道内大量繁殖引起的一种疾病，它主要导致阴道生态平衡的失调，使阴道处于一种病理状态。1984年被医学组织正式命名为细菌性阴道病引起细菌性阴道病的细菌主要是阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis。
阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis属厌氧性，容易在阴道内生长。一旦阴道内环境和酸碱度发生改变，如反复阴道冲洗、滥用药物等，阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis和某些厌氧菌就会大量繁殖，而产生细菌性阴道病时，尤其是性生活后，由于碱性的精液进入了阴道，进一步促进了阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis及厌氧菌的生长繁殖，引起大量的胺类物质释放，于是阴道内就散发出腐败的鱼腥味。
阴道加德纳菌会助长HPV的持续性感染!会增加患子宫颈癌前病变及子宫颈癌的机会!阴道加德纳菌症状臭味“腥”味白带稀薄，颜色为白色或黄色，发烧，腹部压痛和白细胞增多。
但是，感染也可能是无症状的，尤其是在男性中。此外，加德纳菌感染可继续引起其他病理，例如子宫内膜炎，绒毛膜羊膜炎，阴道脓肿，泌尿生殖外科手术后伤口感染，盆腔炎和子宫内感染，这些本身可导致自然流产或不孕。
表皮葡萄球菌
Staphylococcus epidermidis
表皮葡萄球菌是革兰氏阳性细菌，以及属于埃希超过40种的一个金黄色葡萄球菌。它是正常人类菌群的一部分，通常是皮肤菌群，少部分是粘膜菌群。它是兼性厌氧菌。尽管表皮葡萄球菌通常不是致病性的，但免疫系统受损的患者有感染的风险。这些感染通常是医院获得的。表皮葡萄球菌对有导管的人特别重要或其他外科植入物，因为已知会形成在这些设备上生长的生物膜。表皮葡萄球菌是 正常皮肤菌群的一部分，是送往诊断实验室的标本的常见污染物。
脓绿的分泌物，常合并厉害的外阴及阴道的刺激感及红、肿、痛等感染症状，好发于刚手术后或更年期后的妇女。
痤疮丙酸杆菌
Propionibacterium acnes
和皮肤疾病粉刺息息相关，是一种生长相对缓慢的典型革兰氏阳性菌，杆状，兼性厌氧。它会引起慢性睑炎以及眼内炎，特别是后者还需要眼科手术解决。细菌的基因组中测序列工作中已经进行的一项研究显示，一些基因会产生分解皮肤的酶和可能免疫原性的蛋白。
这种细菌在很大程度上是偏利共生的，并且是存在于大多数健康成年人的皮肤上皮肤菌群一部分。它通常在健康青春期的少年的皮肤上是几乎检测不到的。它主要依赖通过在毛囊皮脂腺分泌的皮脂脂肪酸为生，并依赖其他食物为生。
肺炎链球菌
Streptococcus pneumoniae
是一种球状的革兰氏阳性菌。肺炎链球菌于1880年代已被发现能引致肺炎。肺炎链球菌于1926年的最初名字是肺炎双球菌（学名Diplococcus pneumonia），因牠在革兰氏染色中的特征。于1974年，因牠在液体媒介中链的长成，而被重新命名为肺炎链球菌。因牠是肺炎的病原因子，一般都会称牠为肺炎球菌。
传染途径可经由人与人之间直接接触到带菌的口鼻分泌物，或经由 吸入含有此病原菌之飞沫，通常需要长时间或密切接触才可能遭受感染。肺炎链球菌的带菌者可能会因为本身免疫功能减低或同时感染呼吸道病毒性疾病等，导致细菌从呼吸道或血液侵袭器官，进而引发中耳炎、败血症、菌血症、肺炎及脑膜炎。
克雷伯氏肺炎菌
Klebsiella pneumoniae
是肠杆菌科克雷伯氏菌属的一种，属于革兰氏阴性菌，杆状，有大量黏性的多醣形成的荚膜包覆。克雷伯氏肺炎菌可以在人类，特别是免疫力低弱的个体造成肺炎、尿路感染、菌血症等等感染症。然而除了院内感染之外，近年来小区型感染也渐渐增加。在台湾的糖尿病病患中，克雷伯氏菌经常是造成肝脓疡（liver abscess）的病源。克雷伯氏菌可以进行乳糖发酵，属于兼性厌氧生物，它是目前柠檬酸发酵被研究的最清楚的微生物。
德国微生物学家艾德温·克雷伯（Edwin Klebs）首先描述了克雷伯氏肺炎菌，此菌后来因此得名。
1996年，美国北卡罗讷州出现具有A类碳青霉烯酶的克雷伯氏肺炎菌，全名为「克雷伯肺炎杆菌碳青霉烯酶」（KPC，Klebsiella pneumoniae carbapenemase），能使碳青霉烯类抗生素失去药效。
皮屑芽孢菌 (秕糠色马拉癣菌)
Malassezia furfur
马拉色菌属（以前被称为糠秕孢子菌）是一种真菌界的属，被认为是酵母类真菌，本属的物种自然存在于人和动物的皮肤上。如果它导致机会性感染，则可以在胸背等部位引起色素淡化hypopigmentation
秕糠马拉癣菌 M. furfur 在人类疾病中扮演的角色
近年来鉴别皮肤上马拉色菌的研究表明这种菌属能引起绝大多数的皮肤病，比如大部分情况下的头皮屑和脂溢性皮炎是球形马拉色菌属引起的（虽然通常也和限制性马拉色菌属有关）。花斑癣通常也和这种真菌的感染有关。
由于这种真菌需要油脂来生长，因此它通常会感染[脂腺]发达区域，例如：头皮、脸部以及上半身。当这些真菌繁殖速度过快时，细胞的自然更新过程就会受到干扰，瘙痒及皮屑就会出现（和其它真菌或者细菌感染的情况类似）。球形马拉色菌在人的头部皮肤上的数量可以超过一千万个。
维基百科
